1. 热能分级利用：
使烟气温度下降到作动力用已不合适时，再作予热空气及给水式某种工艺过程的加热之用，做到能尽其用才算是合理的。
2. 热管换热器的清灰问题：
由于一般工业炉，特别是锅炉烟气中灰尘很多。目前许多锅炉又没有除尘设备，加之为了强化传热，热管的两端都装有肋片。这就使得热管换热器更容易积灰。
一九七八年日本帝人公司岐阜工厂，为了对排烟管道的腐蚀情况和肋片的堵塞情况进行调查，再外径为38.1mm管上有肋片，分别做成直接冷却式U形管和情况相同的热管，然后插入同一烟道进行了实验。运行六个月后取出，发现二者的表面均附有大量未燃物。但是，直接冷却式U形管上的附着物非常坚固，必须用螺丝刀和铁锤才能除去，而且有所腐蚀。而热管上的附着物非常柔软，是多孔疏松的碳灰，既使用咀吹也能吹掉一些，如果用水冲洗就更好了，冲洗后的热管和新的一样。
尽管实验结果如上，但由于积灰影响，不但降低了热回收效率，而且造成排烟阻力的增加。因此定期清灰对热管换热器的应用来讲，是一个重要问题。
在清灰问题上，从结构设计方面考虑：在适当的管排间设有清灰通道，换热器的两侧设有清灰门，在换热器下面设有清灰的拉板及清灰槽等。
3. 由于价格较高，因此热管换热器成本回收时间较长。日本热管式热交换器成本的回收年限，在排气温度为300℃时，只需一年；在200℃时需二年；在100℃时需要三年。
由于国内热管价格较高故一般热管换热器的成本回收时间为一年至二年。
此外热管换热器还有负荷不均的问题。上述几个方面的问题，都应在热管换热器的应用中加以注意。
